A la luz de la celebración centenaria del Congreso Nacional Misionero, se quiere presentar el modelo de logotipo para representar este Congreso de manera oficial.
Se aprecia en el logo un círculo, representando en él el mundo, una barca sobre el agua y dentro de ella unas personas que sostienen el mapa de Colombia, la vela del barco representa a Cristo y a su vez el número 100 que identifica la celebración. En la parte superior de aprecia la estrella, con ella se quiere identificar a María, como estrella de la nueva evangelización y modelo de discípulos misioneros.
Cada uno de estos elementos tienen un significado especial:

• El círculo representa el mundo, iluminados por el pasaje bíblico de Marcos 16, 5, donde se atiende al mandato categórico de “Id por todo el mundo y anunciad la buena nueva”.
• El mapa de Colombia, sostenido por unas personas, pues fue allí donde se realizó el primer congreso Misionero y la Iglesia colombiana desea ser la primera en el anuncio, para, con toda la Iglesia, caminar juntos hacia el encuentro con Cristo.
• ⁠La barca que se encuentra sobre el agua está inspirada en el texto de Lucas 5, 4, “Boga mar adentro y echa vuestras redes para pescar”, en esta figura está plasmado el querer de Cristo de que todos sus discípulos echen las redes y ganen almas para él.
• La vela del barco representa a Cristo, el Misionero del Padre, y en ella la forma de la cruz que es la bandera de los cristianos, el viento sopla en favor de los misioneros y ellos, llevando a Cristo, buscan siempre la salvación de todos, para que “Todos sean uno”, Juan 17, 21.
• ⁠La estrella simboliza de manera especial a María, como estrella de la nueva evangelización y modelo de discípulos, a ella se encomienda de manera especial la misión de la Iglesia Colombiana para que todos alcancen el querer de su Hijo Jesús.
• ⁠Finalmente se encuentra el lema del XIII Congreso Nacional Misionero.